安装教程
1.在知识兔下载并解压,如图所示,得到snapgene_4.3.10_win.exe安装程序和crack破解文件夹2.双击snapgene_4.3.10_win.exe运行,选择软件安装路径,点击next
3.单击“I Agree”
4.
5.然后我们管理员身份运行ActivationCrack.exe,如图所示,输入用户名,然后点击Patch and Register
6.出现以下界面,点击yes
7.安装完成,如图所示,点击finish退出向导
8.将crack破解文件夹中的文件复制到安装目录中(默认地址C:Program Files (x86)SnapGene),点击替换目标中的文件
9.破解完成
支持功能
一、想象1.DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史
自定义酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。
使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。
从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序。
按名称,位置,大小,颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
按名称,长度,颜色,结合位点,方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复
2.大序列支持
浏览染色体大小序列。
查看 · 搜索 · 缩放
利用SnapGene的高效数据处理功能,扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。
使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。
3.蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图。
地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史
自定义区域,站点,键和序列颜色的显示。
使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。
查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。
按名称,位置,大小,颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。
4.直观的序列编辑
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
标准编辑 · DNA结束
进行插入,删除,替换和大小写更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能。
编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。
5.序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。
6.特征注释
自动注释常用功能,或手动注释新增功能。
自动特征检测 · 手动特征注释
使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。二、模拟
1.限制性站点指标
确认限制性网站适合克隆。
独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质
以粗体显示独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
不要被愚弄,因为限制性位点被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点。
利用工具提示来避免有问题的限制网站。
2.限制性克隆
可视化克隆过程的所有方面。
如果您已经考虑过程,则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
3.PCR
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。
4.重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
5.引物定向诱变
使用诱变引物进行定点诱变。
选择诱变引物,按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
6.网关®克隆
模拟网关® BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间。
为方便起见,分享了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,SnapGene将设计引物。
7.吉布森大会®
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
8.IN-FUSION ®克隆通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法,可用于创建无缝基因融合。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
9.TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效GC克隆。
为方便起见,分享了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
10.退火Oligos
退火两个寡核苷酸形成双链产物。
使用简单的控件添加突出限制克隆。
三、避免错误
使用SnapGene,确保构造符合您的要求,并确认您获得了所需的序列。
1.阅读基因融合的框架
确保构造中的已转换要素符合框架。
链接翻译 · 警告信息
使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样,翻译链接在同一行。如果不是,则翻译在单独的行上。
2.与参考序列对齐
使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
地图概述 · 序列详细信息
请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述,以及存在差异的位置。
四、自动录制
SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录,并将祖先结构存储在最终文件中。
1.全面的“撤销”能力
几乎撤消任何操作。
不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。
2.历史和嵌入式祖先
查看构造的图形历史记录。
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
3.历史色彩使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。
详细了解构建体的组装方式,包括结扎的粘性末端。
五、拥有你的数据
SnapGene允许您根据需要阅读和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
1.安全文件管理
将SnapGene文件保存在所需的位置。
使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。
2.从其他格式导入
阅读许多常见的文件格式。
不仅可以导入DNA序列,还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
3.导出为标准格式
将序列,地图或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。
将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
4.使用SnapGene Viewer共享数据
将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。
只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图,序列和注释,就像在完整的SnapGene界面中一样。
5.对于开发人员
要将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中,请联系我们以获取有关如何读取和写入SnapGene文件的信息。
六、转换文件格式
开放式信息交换至关重要,因此SnapGene和SnapGene Viewer分享了读取和导出常见文件格式的选项。
从其他格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还捕获注释和注释
软件特点
1.为DNA和蛋白质序列添加了多个比对工具。2.实现了macOS的选项卡式窗口支持。
3.已启用将CSV格式的数据库导入集合。
4.为LabArchives ELN添加了文件交换工具。
5.允许的序列跟踪导出为FASTA和纯文本格式。
6.添加了Biotium MW标记物。添加了“φ29 – HindIII”MW标记。
7.添加了“λDNA – EcoT14I”MW标记。
8.添加了Enzynomics MW标记。
功能优点
1.重叠群大会线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。
2.灵活的对齐
现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐,或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。
3.Nicking Enzymes
可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时,可以通过按Delete删除该单链区域。
4.点特征
现在,DNA序列支持零长度点功能,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。
5.酶网站突出显示
常用的酶位点可以用黄金突出显示,以便快速识别。
6.协调一致性增强
多重比对的共识序列具有改进的格式,现在可以复制或导出。
7.用于与参考序列对齐的存储编辑
根据流行的需求,当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时,保留和恢复那些编辑。
8.从其他文件格式导入功能
可以将特征导入到BED,GFF3或GTF格式的DNA序列中。
9.从UniProt导入
可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。
10.进口基因组编译器项目
现在可以在SnapGene中直接打开Genome Compiler项目文件(.gcproj)。对于施工项目文件,在“历史记录”视图中捕获施工历史。
11.引物添加日期
将引物添加到文件时,会记录日期。引物可按添加日期排序。
12.读取和写入对齐文件格式SnapGene可以将对齐导入SAM / BAM和VectorNTI®.cep格式的参考序列,并可以将对齐导出为SAM / BAM格式的参考序列。
下载仅供下载体验和测试学习,不得商用和正当使用。
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